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E.coli殘留總RNA檢測(cè)試劑盒用于定量檢測(cè)各種生物制品中大腸桿菌總RNA的殘留情況,輔助進(jìn)行生物制品的核酸質(zhì)控。本試劑盒使用RT-PCR熒光探針法原理,將反轉(zhuǎn)錄和熒光探針qPCR檢測(cè)技術(shù)融合,可實(shí)現(xiàn)一步法定量檢測(cè)。通過在大腸桿菌含量高、表達(dá)穩(wěn)定的RNA靶標(biāo)上,設(shè)計(jì)特異性引物和探針,通過絕對(duì)定量的方法測(cè)定總RNA殘留。
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E.coli 殘留總RNA檢測(cè)試劑盒
貨號(hào):HG-ER001
E.coli 殘留總RNA試劑盒用于定量檢測(cè)各種生物制品中大腸桿菌總RNA的殘留情況,輔助進(jìn)行生物制品的核酸質(zhì)控。本試劑盒使用RT-PCR熒光探針法原理,將反轉(zhuǎn)錄和熒光探針qPCR檢測(cè)技術(shù)融合,可實(shí)現(xiàn)一步法定量檢測(cè)。通過在大腸桿菌含量高、表達(dá)穩(wěn)定的RNA靶標(biāo)上,設(shè)計(jì)特異性引物和探針,通過絕對(duì)定量的方法測(cè)定總RNA殘留。
100 Reactions
組分 | 管數(shù) | 體積 | 存儲(chǔ)條件 |
---|---|---|---|
One Step RT-qPCR buffer | 1 | 1mL | -20℃ |
One Step Enzyme Mix | 1 | 100μL | -20℃ |
E.coli RNA Primer& Probe Mix | 1 | 370μL | -20℃ |
E.coli RNA定量標(biāo)準(zhǔn)品(2ng/μL) | 1 | 25μL | -20℃ |
RNA IPC Primer&Probe Mix | 1 | 370μL | -20℃ |
ROX High | 1 | 50μL | -20℃ |
ROX Low | 1 | 50μL | -20℃ |
RNA稀釋液 | 2 | 1mL | -20℃ |
所有試劑都于-20℃避光保存與運(yùn)輸,有效期18個(gè)月
1.樣品中大腸桿菌(E.coli)RNA殘留檢測(cè)作為殘留類的檢測(cè)項(xiàng)目,檢測(cè)前需要去除供試品中的DNA,因此需要對(duì)供試品進(jìn)行樣本前處理??蛇x擇使用我司配套的樣本前處理試劑盒,處理方式如下 :
組分名稱 | 單反應(yīng)用量(μL) |
---|---|
DNase I | 1 |
10X Reaction Buffer with MgCl2 | 2 |
RNase Inhibitor | 0.5 |
無酶去離子水 | 12.5 |
供試品 | 4 |
2. 按照上表方式配置供試品 DNaseI 消化液,震蕩混勻,離心 5s;
3. 將配置完成的供試品 DNaseI 消化液置于 37℃恒溫水浴鍋中孵育 60min;
4. 取出孵育后供試品 DNaseI 消化液,瞬時(shí)離心 5s 后置于 65℃干式恒溫器中孵育 10min 滅活 DNase I 酶,將滅活后的供試品DNaseI 消化液放置于 2-8℃冰箱暫存。
1.定量參考品及NTC制備
1.1 將試劑盒中的大腸桿菌RNA定量標(biāo)準(zhǔn)品和RNA稀釋液置于冰上,待完i全融化后,輕微振蕩混勻,短暫離心將液體甩至管底;
1.2 取6支干凈的1.5mL離心管,分別標(biāo)記為ST0,ST1,ST2,ST3,ST4,ST5;
1.3按下表進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)品的梯度稀釋,每次稀釋確保充分混勻后再進(jìn)行下一個(gè)梯度的稀釋。(表格中的體積僅供參考,可根據(jù)實(shí)際實(shí)驗(yàn)需求等比例擴(kuò)大);
稀釋管 | 稀釋體積 | 濃度(fg/μL) |
ST0 | 5 μL定量參考品+ 45 μL RNA稀釋液 | 2.00E+05 |
ST1 | 5 μL ST0 + 45 μL RNA稀釋液 | 2.00E+04 |
ST2 | 5 μL ST1 + 45 μL RNA稀釋液 | 2.00E+03 |
ST3 | 5 μL ST2 + 45 μL RNA稀釋液 | 2.00E+02 |
ST4 | 5 μL ST3 + 45 μL RNA稀釋液 | 2.00E+01 |
ST5 | 5 μL ST4 + 45 μL RNA稀釋液 | 2.00E+00 |
1.4 NTC 的制備:100uL RNA 稀釋液。
2.RT-qPCR反應(yīng)液的制備和加樣
2.1 從冰箱里取出各試劑置于冰上解凍;
2.2 PCR反應(yīng)液配制:詳見表5,One Step RT-qPCR buffer、One Step Enzyme Mix、E.coli RNA Primer& Probe Mix、ROX,這4種試劑可提前預(yù)混成Mix, 再依次加入5μL標(biāo)曲 (ST1/ST2/ST3/ST4/ST5)、NTC、供試品溶液,混勻。每個(gè)樣各做三個(gè)平行。
2.3 根據(jù)反應(yīng)孔數(shù)計(jì)算本次所需的Mix混合液總量:
Mix混合液 =(反應(yīng)孔數(shù)+2)× (10+1+3.6+0.4) μL(含有2孔的損失量)
加樣完成密封好管子后,請(qǐng)先低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底,再震蕩混勻5 sec以上,完i全混勻反應(yīng)液,再低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底,如有氣泡,需將氣泡排盡。
組分 | 單孔反應(yīng)(μL) | 備注 |
One Step RT-qPCR buffer | 10 | 可以提前預(yù)混Mix,每孔加 15μL mix再對(duì)應(yīng)加5μL標(biāo)曲/ NTC/樣品 |
One Step Enzyme Mix | 1 | |
E.coli RNA Primer&Probe Mix | 3.6 | |
ROX | 0.4 | |
標(biāo)曲/NTC/樣品 | 5 | |
總體積 | 20 |
RT-qPCR反應(yīng)液配制表
*請(qǐng)對(duì)應(yīng)機(jī)型選擇適配的ROX;若機(jī)型適配為no ROX,請(qǐng)加入等體積的去離子水(要求無核酸及核酸酶污染級(jí)去離子水)。
3. IPC組配制反應(yīng)液的制備和加樣(如果在檢測(cè)中已經(jīng)有如加標(biāo)回收等方式,IPC檢測(cè)可以取消)每次實(shí)驗(yàn)需做一個(gè)無模板對(duì)照(IPC-NTC)和各個(gè)待測(cè)樣本的IPC(IPC-S)檢測(cè),根據(jù)下表:
組分 | 單孔反應(yīng)(μL) | 備注 |
One Step RT-qPCR buffer | 10 | 可以提前預(yù)混Mix,每孔加 15μL mix 再對(duì)應(yīng)加5μL IPC-樣 品 / IPC-NTC |
One Step Enzyme Mix | 1 | |
RNA IPC Primer&Probe Mix | 3.6 | |
ROX | 0.4 | |
IPC-NTC / IPC-樣品 | 5 | |
總體積 | 20 |
IPC RT-qPCR反應(yīng)液配制表
備注:
加標(biāo)體系ERC:90μL 樣品+10μL ST3;
加標(biāo)回收率=ERC/(0.9*樣品+0.1*ST3);(加標(biāo)回收率質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn):50%~150%)
加標(biāo)回收與IPC二選一,如選擇加標(biāo)回收,可將表7中IPC-S更換為ERC-S。
4.反應(yīng)孔排版示例
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | |
A | ST1 | ST1 | ST1 | S1 | S1 | S1 | ||||||
B | ST2 | ST2 | ST2 | S2 | S2 | S2 | ||||||
C | ST3 | ST3 | ST3 | S3 | S3 | S3 | ||||||
D | ST4 | ST4 | ST4 | |||||||||
E | ST5 | ST5 | ST5 | |||||||||
F | IPC-S1 | IPC-S1 | IPC-S1 | |||||||||
G | NTC | NTC | NTC | IPC-S2 | IPC-S2 | IPC-S2 | ||||||
H | IPC-NTC | IPC-NTC | IPC-NTC | IPC-S3 | IPC-S3 | IPC-S3 |
備注:該示例表示的是檢測(cè)5個(gè)濃度梯度的RNA標(biāo)準(zhǔn)曲線、1個(gè)無模板對(duì)照NTC、3個(gè)待測(cè)樣本。針對(duì)IPC的無模板對(duì)照(IPC-NTC)和待測(cè)樣本的 IPC(IPC-S1,IPC-S2,IPC-S3)。每個(gè)檢測(cè)做3個(gè)重復(fù)孔。實(shí)際檢測(cè)時(shí)可根據(jù)樣本多少,參照上表示例進(jìn)行96孔板排版加樣。
加樣完成后將96孔板用光學(xué)膜封閉,輕微震蕩混勻,用96孔板專用離心機(jī)短暫離心將液體全部甩至管底后放入qPCR儀中。
(以ABI公司7500 qPCR儀,軟件版本V2.0.6為例)
1.創(chuàng)建空白新程序,選擇絕對(duì)定量檢測(cè)模板,taqman探針法。
2.創(chuàng)建新檢測(cè)探針,命名為E.coli RNA,選擇報(bào)告熒光基團(tuán)為FAM,猝滅熒光基團(tuán)為none;創(chuàng)建新檢測(cè)探針,命名為RNA IPC,選擇報(bào)告熒光基團(tuán)為VIC,猝滅熒光基團(tuán)為none;檢測(cè)參比熒光為 ROX。
3.設(shè)置三步法反應(yīng)程序如下表:反應(yīng)體積 20μL。
循環(huán)步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
逆轉(zhuǎn)錄 | 50℃ | 15min | 1 |
預(yù)變性 | 95℃ | 30 sec | 1 |
變性 | 95℃ | 10sec | 45 |
退火/延伸(收集熒光) | 60℃ | 40 sec |
反應(yīng)程序
4. 運(yùn)行PCR程序。
1. 在Results 的Amplification Plot 中,可初步查看擴(kuò)增曲線的形態(tài)是否正常。機(jī)器通常會(huì)自動(dòng)設(shè)置閾值(Threshold )和基線(Baseline),當(dāng)target設(shè)置等不同時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)多個(gè)閾值,而導(dǎo)致結(jié)果分析有誤,此時(shí)請(qǐng)手動(dòng)設(shè)置閾值線,但需確保設(shè)置的閾值線在指數(shù)擴(kuò)增區(qū),如通常Threshold設(shè)置為0.15,選Auto Baseline,點(diǎn)擊Analyze,可看到調(diào)整后的結(jié)果。
2. 在Results的Standard Curve 中,可讀取標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率(Slope)、截距(Intercept)、R2。 可接受標(biāo)準(zhǔn)Effective:85%~110%,R2≥0.98;
3. 在Results 的Report中,Mean Quantity 一欄可讀取無模板對(duì)照 NTC、待測(cè)樣本的檢測(cè)值,單位為fg/μL。NTC的Ct值應(yīng)大于ST5的Ct值,檢測(cè)值應(yīng)低2fg/μL。
4. 分析IPC的Ct值,正常情況下樣本的Ct-IPC值應(yīng)該與無模板對(duì)照NTC的Ct-IPC值一致或±2。如樣本的Ct-IPC值與無模板對(duì)照NTC的Ct-IPC值相比明顯增大,則表明樣本可能存在明顯抑制。
5. E.coli RNA 殘留量計(jì)算:
異常數(shù)據(jù)及檢測(cè)過程出現(xiàn)意外情況比如管漏液,樣本蒸發(fā)以及樣本加錯(cuò)等,其產(chǎn)生的數(shù)據(jù)應(yīng)刪除,并在檢測(cè)記錄中說明原因,其他正常的數(shù)據(jù)可以繼續(xù)應(yīng)用于檢測(cè)結(jié)果的計(jì)算中
1. 本試劑盒已通過穩(wěn)定性(凍融等因素)的驗(yàn)證,無需分裝。
2. 陰性樣品和陽性樣品(參考品和待測(cè)樣品等)的配制環(huán)境需區(qū)分區(qū)域,不可在一個(gè)區(qū)域內(nèi)操作,配制人員需穿戴整齊,戴
好口罩、手套和穿好潔凈服。
3. 注意在不同加樣步驟間及時(shí)更換吸頭,避免交叉污染,避免長(zhǎng)時(shí)開蓋。
4. 試劑盒必須在有效期內(nèi)使用。
5. 試劑盒內(nèi)所有組分建議在低溫環(huán)境融化后使用。
6. 只有嚴(yán)格遵守說明書的操作方法,全部使用本試劑盒配套的試劑才能保證優(yōu)良檢測(cè)效果。
7. 盡量在當(dāng)天完成樣本前處理純化后立即進(jìn)行后續(xù)qPCR檢測(cè),以保證檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
8. 最終的試驗(yàn)結(jié)果與試劑的有效性、操作者的操作方法及試驗(yàn)環(huán)境密切相關(guān)。
9. 公司只對(duì)試劑盒本身負(fù)責(zé),不對(duì)因使用該試劑盒所造成的樣本消耗負(fù)責(zé),請(qǐng)使用者使用前充分考慮到樣本的可能使用量,
預(yù)留充足的樣本。
10. 本試劑盒僅供體外研究使用,不用于臨床診斷。
E.coli殘留總RNA檢測(cè)試劑盒產(chǎn)品訂購,請(qǐng)聯(lián)系柏萊源(天津)生物科技有限公司!
柏萊源(天津)生物科技有限公司的優(yōu)勢(shì):
現(xiàn)貨供應(yīng):公司庫存充足,可快速發(fā)貨,減少用戶等待時(shí)間。
效期保障:嚴(yán)格把控產(chǎn)品質(zhì)量,確保試劑效期新鮮,保障實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。
專業(yè)技術(shù)支持:提供詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)方案和技術(shù)指導(dǎo),幫助用戶優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件,提高實(shí)驗(yàn)成功率。
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